Спустя девяносто лет после рождения Будды и восемь лет после его Паринирваны, в этот мир явился Гуру Падмасамбхава, первая эманация Будды, и получил полное собрание учений от многих просветлённых мастеров. Падмасамбхава передал Дзогчен Кхандро Нингтиг многочисленным существам в восьми священных местах Индии и Китая, и принёс и распространил Буддизм по всему Тибету.
Его главная ученица, дакини Йеше Цогьял также передавала Дзогчен Кхандро Ньингтиг многим практикующим, которые затем достигли просветления. Эта традиция передавалась на протяжении веков и позже перешла от Лончена Рабджама к Дзогчен Падма Ригзину. На сегодняшний день Дзогчен Кхандро Нингтиг живёт в сердцах ваджрных учителей Дзогчен Монастыря. Наш Учитель, Великий Йогин Естественного Совершенства Дзогчен Кхенпо Чога Ринпоче является двадцать четвёртым держателем Дзогчен Кхандро Нингтиг.